Financia projetos de interesse do Governo do Estado, executados pelas próprias instituições estaduais, em atendimento às políticas definidas no âmbito do CONECIT e supervisionados pela Secretaria de Estado de Ciência, Tecnologia e Ensino Superior (SECTES). Neste caso, as instituições não solicitam o apoio diretamente à FAPEMIG, pois as demandas e propostas de financiamento chegam da SECTES para a Fundação, atendendo a critérios relacionados às políticas públicas na área de Ciência, Tecnologia e Inovação.